Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd1Q6PIP5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms