Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFQ7

Rasa4, Ras GTPase-activating protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa4Q6PFQ7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms