Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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