Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gapvd1Q6PAR5 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gapvd1Q6PAR5 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gapvd1Q6PAR5 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gapvd1Q6PAR5 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gapvd1Q6PAR5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gapvd1Q6PAR5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gapvd1Q6PAR5 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gapvd1Q6PAR5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gapvd1Q6PAR5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gapvd1Q6PAR5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gapvd1Q6PAR5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gapvd1Q6PAR5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gapvd1Q6PAR5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gapvd1Q6PAR5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gapvd1Q6PAR5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gapvd1Q6PAR5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gapvd1Q6PAR5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gapvd1Q6PAR5 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gapvd1Q6PAR5 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gapvd1Q6PAR5 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gapvd1Q6PAR5 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gapvd1Q6PAR5 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gapvd1Q6PAR5 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gapvd1Q6PAR5 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms