Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slf2Q6P9P0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slf2Q6P9P0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms