Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms