Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Podnl1Q6P3Y9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Podnl1Q6P3Y9 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Podnl1Q6P3Y9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Podnl1Q6P3Y9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Podnl1Q6P3Y9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Podnl1Q6P3Y9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Podnl1Q6P3Y9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Podnl1Q6P3Y9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Podnl1Q6P3Y9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Podnl1Q6P3Y9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Podnl1Q6P3Y9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Podnl1Q6P3Y9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Podnl1Q6P3Y9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Podnl1Q6P3Y9 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Podnl1Q6P3Y9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Podnl1Q6P3Y9 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Podnl1Q6P3Y9 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Podnl1Q6P3Y9 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Podnl1Q6P3Y9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Podnl1Q6P3Y9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Podnl1Q6P3Y9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Podnl1Q6P3Y9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Podnl1Q6P3Y9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Podnl1Q6P3Y9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Podnl1Q6P3Y9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Podnl1Q6P3Y9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Podnl1Q6P3Y9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Podnl1Q6P3Y9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Podnl1Q6P3Y9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Podnl1Q6P3Y9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Podnl1Q6P3Y9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Podnl1Q6P3Y9 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Podnl1Q6P3Y9 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms