Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A4

Vsig8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig8Q6P3A4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vsig8Q6P3A4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms