Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casc4Q6P2L7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casc4Q6P2L7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casc4Q6P2L7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casc4Q6P2L7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casc4Q6P2L7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casc4Q6P2L7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casc4Q6P2L7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casc4Q6P2L7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casc4Q6P2L7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc4Q6P2L7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc4Q6P2L7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc4Q6P2L7 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc4Q6P2L7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc4Q6P2L7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc4Q6P2L7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc4Q6P2L7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc4Q6P2L7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc4Q6P2L7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc4Q6P2L7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc4Q6P2L7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc4Q6P2L7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc4Q6P2L7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc4Q6P2L7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc4Q6P2L7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc4Q6P2L7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc4Q6P2L7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc4Q6P2L7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc4Q6P2L7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc4Q6P2L7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc4Q6P2L7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc4Q6P2L7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc4Q6P2L7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc4Q6P2L7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc4Q6P2L7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casc4Q6P2L7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms