Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2B1

Tnpo3, Transportin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo3Q6P2B1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnpo3Q6P2B1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnpo3Q6P2B1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnpo3Q6P2B1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnpo3Q6P2B1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnpo3Q6P2B1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnpo3Q6P2B1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnpo3Q6P2B1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnpo3Q6P2B1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnpo3Q6P2B1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnpo3Q6P2B1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnpo3Q6P2B1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnpo3Q6P2B1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnpo3Q6P2B1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnpo3Q6P2B1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnpo3Q6P2B1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnpo3Q6P2B1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnpo3Q6P2B1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnpo3Q6P2B1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnpo3Q6P2B1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnpo3Q6P2B1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnpo3Q6P2B1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms