Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Soga3Q6NZL0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms