Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SphkapQ6NSW3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SphkapQ6NSW3 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms