Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms