Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt39Q6IFX4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms