Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6DFW0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6DFW0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6DFW0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6DFW0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6DFW0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6DFW0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6DFW0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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