Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms