Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms