Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z98

Brsk2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk2Q69Z98 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brsk2Q69Z98 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brsk2Q69Z98 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brsk2Q69Z98 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brsk2Q69Z98 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brsk2Q69Z98 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brsk2Q69Z98 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brsk2Q69Z98 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brsk2Q69Z98 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brsk2Q69Z98 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brsk2Q69Z98 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Brsk2Q69Z98 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Brsk2Q69Z98 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brsk2Q69Z98 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brsk2Q69Z98 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brsk2Q69Z98 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brsk2Q69Z98 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brsk2Q69Z98 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brsk2Q69Z98 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brsk2Q69Z98 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brsk2Q69Z98 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Brsk2Q69Z98 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brsk2Q69Z98 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brsk2Q69Z98 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brsk2Q69Z98 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms