Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Spty2d1Q68FG3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms