Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp9cQ66X01 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms