Protein–RNA interactions for Protein: Q64092

Tfe3, Transcription factor E3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfe3Q64092 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tfe3Q64092 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms