Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col4a5Q63ZW6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col4a5Q63ZW6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col4a5Q63ZW6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col4a5Q63ZW6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col4a5Q63ZW6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col4a5Q63ZW6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col4a5Q63ZW6 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col4a5Q63ZW6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col4a5Q63ZW6 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Col4a5Q63ZW6 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Col4a5Q63ZW6 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col4a5Q63ZW6 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col4a5Q63ZW6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col4a5Q63ZW6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col4a5Q63ZW6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a5Q63ZW6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a5Q63ZW6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a5Q63ZW6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a5Q63ZW6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a5Q63ZW6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a5Q63ZW6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a5Q63ZW6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a5Q63ZW6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a5Q63ZW6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a5Q63ZW6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a5Q63ZW6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a5Q63ZW6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a5Q63ZW6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a5Q63ZW6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a5Q63ZW6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a5Q63ZW6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms