Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Lcn4Q62472 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Lcn4Q62472 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Lcn4Q62472 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Lcn4Q62472 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Lcn4Q62472 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Lcn4Q62472 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Lcn4Q62472 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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