Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ss18Q62280 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ss18Q62280 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ss18Q62280 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Ss18Q62280 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Ss18Q62280 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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