Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms