Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six3Q62233 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Six3Q62233 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Six3Q62233 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Six3Q62233 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six3Q62233 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Six3Q62233 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms