Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six2Q62232 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Six2Q62232 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six2Q62232 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Six2Q62232 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Six2Q62232 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Six2Q62232 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Six2Q62232 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Six2Q62232 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Six2Q62232 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Six2Q62232 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Six2Q62232 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Six2Q62232 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six2Q62232 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six2Q62232 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms