Protein–RNA interactions for Protein: Q62231

Six1, Homeobox protein SIX1, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six1Q62231 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Six1Q62231 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Six1Q62231 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Six1Q62231 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Six1Q62231 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Six1Q62231 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Six1Q62231 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Six1Q62231 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Six1Q62231 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Six1Q62231 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Six1Q62231 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Six1Q62231 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Six1Q62231 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Six1Q62231 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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