Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ssr4Q62186 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ssr4Q62186 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ssr4Q62186 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ssr4Q62186 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ssr4Q62186 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ssr4Q62186 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms