Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

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Length 760 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4aQ62178 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms