Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms