Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.5 ms