Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms