Protein–RNA interactions for Protein: Q61152

Ptpn18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn18Q61152 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ptpn18Q61152 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ptpn18Q61152 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ptpn18Q61152 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ptpn18Q61152 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ptpn18Q61152 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ptpn18Q61152 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ptpn18Q61152 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ptpn18Q61152 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptpn18Q61152 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn18Q61152 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn18Q61152 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn18Q61152 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn18Q61152 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn18Q61152 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn18Q61152 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn18Q61152 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn18Q61152 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn18Q61152 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn18Q61152 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn18Q61152 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn18Q61152 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn18Q61152 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn18Q61152 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn18Q61152 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn18Q61152 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn18Q61152 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn18Q61152 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn18Q61152 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn18Q61152 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn18Q61152 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn18Q61152 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn18Q61152 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn18Q61152 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn18Q61152 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn18Q61152 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn18Q61152 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn18Q61152 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms