Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln3Q61124 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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