Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp4Q61107 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp4Q61107 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp4Q61107 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp4Q61107 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp4Q61107 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp4Q61107 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp4Q61107 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp4Q61107 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4Q61107 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4Q61107 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4Q61107 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4Q61107 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4Q61107 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4Q61107 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms