Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms