Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms