Protein–RNA interactions for Protein: Q60604

Scin, Adseverin, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScinQ60604 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScinQ60604 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScinQ60604 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScinQ60604 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScinQ60604 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScinQ60604 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScinQ60604 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScinQ60604 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScinQ60604 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScinQ60604 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScinQ60604 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms