Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CttnQ60598 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CttnQ60598 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CttnQ60598 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CttnQ60598 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CttnQ60598 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CttnQ60598 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CttnQ60598 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CttnQ60598 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CttnQ60598 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CttnQ60598 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CttnQ60598 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CttnQ60598 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CttnQ60598 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms