Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf15Q5UBV8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf15Q5UBV8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms