Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Myh1Q5SX40 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms