Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psme4Q5SSW2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms