Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim58Q5NCC9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim58Q5NCC9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim58Q5NCC9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim58Q5NCC9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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