Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim41Q5NCC3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim41Q5NCC3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms