Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms