Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Gm3558Q5FWC9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gm3558Q5FWC9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gm3558Q5FWC9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gm3558Q5FWC9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gm3558Q5FWC9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gm3558Q5FWC9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gm3558Q5FWC9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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