Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms