Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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