Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdp2Q504M2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdp2Q504M2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdp2Q504M2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdp2Q504M2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdp2Q504M2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdp2Q504M2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdp2Q504M2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdp2Q504M2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdp2Q504M2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdp2Q504M2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdp2Q504M2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdp2Q504M2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdp2Q504M2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdp2Q504M2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdp2Q504M2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdp2Q504M2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdp2Q504M2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdp2Q504M2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdp2Q504M2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdp2Q504M2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdp2Q504M2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdp2Q504M2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdp2Q504M2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdp2Q504M2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdp2Q504M2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdp2Q504M2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms